新的多人游戏“猎人”模式，由两位身穿纳米服的猎人对付一队Cell士兵。每干掉一名Cell士兵，那名玩家就变身成新的猎人。幸存下来的玩家会让游戏越来越紧张刺激。而作为猎人，任务就是在规定时间内把所有士兵变成猎人。

　　《孤岛危机3》的联机游戏会包括前作中的“Crash Site”模式，在《孤岛危机2》中非常流行和经典，经过重新加工和升级后，将会在新作中回归。在前作中，多人联机虽然是重要的一部分，但不是游戏最核心的内容。总结之前的经验，在《孤岛危机3》中，让进入多人联机的门槛降低，不同于前作那么复杂，往往需要数小时才能上手，这样造成了玩家的流失，所以这次缩短了上手需要的时间，同时更加社交化，邀请朋友一起玩会十分有趣。

　　还有其他特性，比如挑战模式。玩家可以从朋友或者大厅那里接到挑战。与大厅中最好的玩家直接挑战，或者由开发者随即挑选挑战。所有这些努力都是为了让《孤岛危机3》的多人联机更加有趣。