终极生化少女是一款移植自PS2平台上的一款纯爱RPG游戏，故事讲的是男主角和6名美少女之间的情感纠葛故事。故事的背景发生在2009年的一天，一个小行星撞击火星之后，火星的轨道发生偏离，导致人们可以在地球上直接看到一个巨大的火星本体，之后世界各地开始出现各种拥有超能力的人士。　　地球上的各大国家争相招揽这些异能人士，希望让其成为本国的高端战力。在一年之后，东方出现一个新兴的国家马尼特共和国，其拥有世界上最高端的ESP 活体兵器技术，向世界大国美国以及其同盟国日本发动了猛烈的攻势。由于抵挡不住攻击，日本政府在2016迁都之马县前桥市，游戏的背景介绍就到这里了。　　终极生化少女玩家将扮演主角绫濑优弥，他的身世很凄惨，从小就由于战争父母双亡，在姑姑的抚养下成长。在一次偶然的机会下，他救了意图自杀的女同学朝霞天，后来发现其是ESP能力者。