Primer Premier 5.0版是一款非常专业的引物设计软件。该工具具有引物自动搜索功能，以用来PCR或测序引物以及杂交探针的设计，主要界面由4个部分组成，分别是序列编辑窗口、引物设计窗口、酶切分析窗口、纹基分析窗口，非常优秀。

【功能特点】

　　1、软件的主要功能分四种，即引物设计、限制性内切酶位点分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。此外，该软件还有一些特殊功能，其中最重要的是设计简并引物，另外还有序列"朗读"、DNA 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。

　　2、还可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择，有纤毛虫大核（Ciliate Macronuclear）、无脊椎动物线粒体（Invertebrate Mitochondrion）、支原体（Mycoplasma）、植物线粒体（Plant Mitochondrion）、原生动物线粒体（Protozoan Mitochondrion）、一般标准（Standard）、脊椎动物线粒体（Vertebrate Mito-chondrion）和酵母线粒体（Yeast Mitochondrion）。

【更新内容】

　　1、种间交叉引物设计：利用来自多个物种的序列设计扩增引物

　　2、病理检测引物设计：可以用在高保区域设计引物

　　3、等位基因特效引物：设计专用于扩增某一类相关序列中特定成员的引物